联合市场协议旨在通过显著加速糖聚糖表征来推进糖生物学

赛默飞世尔科技公司和PREMIER Biosoft公司最近宣布了一项协议，将共同销售PREMIER Biosoft公司的SimGlycan®软件。该协议旨在通过自动解释Thermo Scientific质谱仪系统产生的丰富数据，大大加快复杂聚糖的表征，从而推进糖生物学的发展。聚糖——在几乎所有多细胞生物中发现的附着在蛋白质和脂类上的低聚糖或多糖分子——在蛋白质折叠、免疫功能和能量储存等各种生物过程中起着重要作用。由于聚糖具有作为疾病标记物的潜力，并且由于生物基药物中聚糖的变化会影响药物的功能，简化和加速聚糖结构阐明的生物信息学工具是科学界和制药业的强烈兴趣。

由于质谱仪的灵敏度和分析复杂聚糖混合物的能力，质谱已经成为聚糖结构阐发的有力工具。然而，基于ms的方法生成大量的数据，在SimGlycan软件引入之前，这些数据需要数小时或数天的繁琐手工解释。SimGlycan软件自动将实验获得的质谱与综合数据库进行匹配，并生成一个候选聚糖结构的列表，以反映匹配质量。此外，有关所提议的聚糖结构的相关生物学信息，如聚糖类和生物途径，可通过交互式链接立即获得。与其他软件不同，SimGlycan可以处理由Thermo Scientific质谱仪产生的多级/顺序质谱(MSn)数据。这种独特的能力有助于区分在MS/MS水平上具有相似片段离子的聚糖，并解决它们的碳水化合物分布和分支模式。在糖基结构异构体之间的区分通常需要多达6或7级的破碎。SimGlycan软件设计用于Thermo Scientific Orbitrap和离子阱质谱仪，包括Thermo Scientific LTQ, LTQ Velos和Velos Pro线性离子阱系统以及LTQ Orbitrap XL, Orbitrap Velos, Orbitrap Velos Pro, Orbitrap Elite和MALDI Orbitrap混合系统。