新的集成生物学功能添加到生物信息学套件

安捷伦科技公司(Agilent Technologies Inc .)发布了genspring 12.0，这是其流行的生物信息学软件的重大扩展，旨在使医学科学突破达到新的水平。有了新版本，genspring用户现在可以分析下一代测序数据，并在熟悉的软件环境中跨多个“组学”平台在通路层面进行联合分析。

这些新功能扩展了现有的genspring模块，用于转录组、遗传、代谢组和蛋白质组数据分析。

genspring 12.0带有新的集成路径架构师模块，所有客户都可以免费试用，从现在到8月17日。

新版本包括用于下一代测序的NGS模块。NGS模块的设计和测试与安捷伦的SureSelect靶向富集平台以及非靶向的下一代测序实验一起使用。NGS模块的一个组成部分是QC管理器，它提供了图形化目标丰富、基础质量、映射和对齐QC的工具。genspring NGS模块中的DNA-SEQ工作流程包括用于识别和分析已知和新变体、注释SNP、预测SNP效应和检测结构变体的工具。RNA-SEQ工作流程支持绝对和相对空间的mRNA分析，包括基因和剪接变体的检测和差异表达分析。这包括新的基因和外显子检测，基因融合分析，以及复杂的统计和途径分析工具。

genspring路径架构师模块使科学家能够查看和分析精心策划的路径内容。雷电竞网址这是通过利用维基路径实现的，这是一个用于构建、注释和查询生物路径的公开资源。通过与另一个公开可用资源BridgeDB集成，还支持跨多个公共和专有注释数据库的生物标识符映射。

genspring 12.0自定义功能现在包括对Jython和R编程语言的增强集成。使用嵌入式脚本编辑器，生物信息学科学家可以在genspring 12.0编程框架中编写、执行和保存他们自雷电竞网址己的算法和工作流。

安捷伦genspring 12.0是与Strand Scientific Intelligence, Inc合作开发的。它由Strand的Avadis平台提供支持，该平台旨在使科学家简化和解决复杂的生命科学挑战。雷电竞网址